Hola buenas noches

TU puedes particionar el disco duro en varias partes y mantener intacta la partición oculta y este debería de funcionar sin problema si algún día lo llegaras a necesitar

Aunque yo si fuera tu cojería por ejemplo un USB de unos 8 Gb y haría un USB con el Recovery y lo mantendría guardado,por si falla uno pues tendría el otro

Te lo digo porque si por un ejemplo te instalas el sitema operativo de Linux podría dañar accidentalmente la partición con el Recovery que a mi eso me pasó una vez y desde entonces nunca más me funcionó

Espero que sea esto a lo que te refería

Un saludo y suerte en las particiones